Tojikiston o‘z konstitutsiyasiga ko‘ra dunyoviy davlat. Har qanday diniy tashkilot va birlashmalar faoliyat yuritishi uchun davlat qaydidan o‘tishi kerak. Mamlakat bo‘yicha 4000 dan ortiq masjidlar amal qiladi, shuningdek, o’nlab nasroniy tashkilotlar.